Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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PUM3Q15397 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PUM3Q15397 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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