Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD3Q15054 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD3Q15054 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLD3Q15054 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD3Q15054 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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