Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIXQ14938 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIXQ14938 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms