Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK13Q14004 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK13Q14004 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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