Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA9Q13797 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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ITGA9Q13797 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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ITGA9Q13797 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ITGA9Q13797 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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