Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NAE1Q13564 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NAE1Q13564 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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