Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TUBB3Q13509 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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TUBB3Q13509 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TUBB3Q13509 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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