Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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FOXE3Q13461 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
FOXE3Q13461 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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