Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NME3Q13232 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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