Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPA4Q13156 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RPA4Q13156 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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RPA4Q13156 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPA4Q13156 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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