Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUSP4Q13115 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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