Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHAF1AQ13111 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
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