Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CNTN1Q12860 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTN1Q12860 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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