Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTF3C1Q12789 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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GTF3C1Q12789 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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GTF3C1Q12789 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTF3C1Q12789 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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