Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
FOXO1Q12778 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FOXO1Q12778 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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