Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBRQ0VD83 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms