Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CD47Q08722 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms