Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLEQ07864 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
POLEQ07864 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms