Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TFF3Q07654 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TFF3Q07654 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TFF3Q07654 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TFF3Q07654 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms