Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DEUP1Q05D60 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DEUP1Q05D60 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms