Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GBE1Q04446 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GBE1Q04446 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms