Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUCB1Q02818 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUCB1Q02818 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms