Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
DEFA6Q01524 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
DEFA6Q01524 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms