Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SKOR1P84550 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SKOR1P84550 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms