Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMF1P82094 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMF1P82094 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMF1P82094 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms