Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTA2P62736 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms