Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
LINC01547P58512 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms