Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCBP4P57723 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PCBP4P57723 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms