Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME5P56597 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NME5P56597 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME5P56597 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME5P56597 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
NME5P56597 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
NME5P56597 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
NME5P56597 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms