Protein–RNA interactions for Protein: P55327

TPD52, Tumor protein D52, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52P55327 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TPD52P55327 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52P55327 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms