Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAD23BP54727 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms