Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SMARCA2P51531 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms