Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC11A1P49279 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms