Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHI3L1P36222 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms