Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL9P32969 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL9P32969 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL9P32969 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL9P32969 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL9P32969 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL9P32969 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms