Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
OTX2P32243 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms