Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CMPK1P30085 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMPK1P30085 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms