Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABRB3P28472 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GABRB3P28472 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms