Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLD1P28340 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLD1P28340 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLD1P28340 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLD1P28340 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms