Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD53P19397 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD53P19397 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD53P19397 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms