Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC130P13994 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms