Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
VPREB1P12018 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms