Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TOP2AP11388 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TOP2AP11388 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms