Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLUP10909 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLUP10909 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLUP10909 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms