Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHGAP10645 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHGAP10645 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHGAP10645 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms