Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C8orf88P0DMB2 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms