Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KLK3P07288 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLK3P07288 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLK3P07288 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KLK3P07288 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLK3P07288 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms