Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGAVP06756 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms