Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POP4O95707 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POP4O95707 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POP4O95707 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POP4O95707 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms