Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ZIC3O60481 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms